• Lingkaran (berwarna kuning) Berarti kemuliaan, lambang matahari baru.
• Perahu (berwarna biru) Berarti harapan,lambang peziarahan insan Kanisius..
• Dua buah gelombang (berwarna biru), Berarti dua buku yang dibuka yaitu Kitab Suci dan llmu Pengetahuan.

Arti lambang KANISIUS secara keseluruhan adalah :

IMAN dan ILMU mendasari perjalanan atau peziarahan insan Kanisius dalam menyongsong kehidupan dan kemuliaan baru